集装箱房的屋顶和墙体都是由各种材料拼接而成，并非一个整体，这样的结构在连接处会有缝隙，也给雨水的渗透留下了隐患。一般人们会在这些缝隙上抹上密封胶用于密封防水，减少雨水渗透的概率。对于集装箱，这些工序全部都在工厂内完成，1大限度的保证密封胶的完整性，更好的保证住人集装箱房的防水性能。对于平顶型的集装箱房，屋顶漏水的概率会大大增加，下雨时雨水会在屋顶上停留一段时间，使得屋顶有更多的机会渗透雨水。一般都是用夹芯板做屋顶，夹芯板连接处涂抹密封胶进行防水。这些密封胶有效期一般在1-2年，如果长期在雨水中浸泡，失效会更快，因此这种类型的活动房屋顶一般每年都要检修，，将已经失效的密封胶去除，换上新的密封胶，以保证其防水性能。
集装箱房屋具备很多传统房屋无法达到的性能.首先他很安全,抗震9度,满足抗震要求,因为整个房屋的承重结构为住人集装箱龙骨结构,钢结构具有很好的延展性和韧性,中绝1对不会倒塌;住人集装箱房屋还具有防台风的性能,经受12级台风平安无事,如果是在岛屿,还可以有相应的加固措施;住人集装箱房屋还能承受暴雪的打击,设计承重1.5米积雪,太阳能热水器、电池板等设备放在屋顶没有任何问题
使用集装箱转运货物，可直接在发货人的仓库装货，运到收货人的仓库卸货，中途更换车、船时，无须将货物从箱内取出换装。一定程度上降低了装卸人工成本。集装箱房屋具有方便，规整，可移动，建造速度快，可塑性强等这些优点兼具于一身，是国内开始比较流行的装配式建筑之一。在保障房供应比较紧张或购买人有限制的情况下，开发“住人集装箱”也许是未来解决低收入人群住房难问题的有效途径。