由于无尘净化车间的平面和空间布置特殊，在进行各项技术设施的系统设计、设备配置时应特别注意按规定选用符合要求的系统和设备。一般过滤器从洁净室内进行更换，而风机多数需要在龙骨架顶端(静压箱内部)维护，但如果静压箱没有足够的高度无法从内部维护风机时，那么就要考虑从净化车间内部进行维护风机的可行性了。净化车间的建筑布局上一般在厂房外设置一环形密封走廊。它使洁净区与外界有了一个缓冲地带。能够防止外界污染同时也相对节能。
施工企业承担对洁净厂房工程内各设计图纸进行深化的施工详图设计时，应执行现行《洁净厂房设计规范》GB50073的相关规定，并应加强设计质量管理，具有质量管理体系根据《洁净厂房设计规范》车间的墙体和吊顶必须采用不产尘、不积尘表面平滑的材料施工，并且不能在车间中存在死角。净化车间天花板，墙板材采用50MM厚夹芯彩钢制作，刚性强，美观，圆弧墙角、门、窗框等，采用氧化铝型材制作，送风管用热镀锌钢板制成
目前很多行业都需要安装使用净化车间来进行生产加工，在这些行业领域中车间的设计工作很主要。一般情况下车间中会选用比较厚的夹芯彩钢板来进行安装应用，这种材质在使用的过程中可以达到一定的强度标准，材质比较，洁净车间附近有容纳废水排放的天然水体。厂内任何设施、设备等均不得成为周围环境的污染源,不得产生有毒、有害、不良气体、粉尘及其他污染物等有碍卫生的情况发生。洁净室内工作人员应尽量减少走动，减少气流干扰，不得化浓妆和佩带外饰物，操作人员好戴洁净手套进行操作。在工作活动中，要禁量考虑减少发尘量。
洁净车间附近有容纳废水排放的天然水体。厂内任何设施、设备等均不得成为周围环境的污染源,不得产生有毒、有害、不良气体、粉尘及其他污染物等有碍卫生的情况发生。让生产操作可以符合规定标准，另外净化车间的工程施工方式很简单，不需要复杂的操作流程就可以达到安装使用目的，所以车间的实际应用效果很好，也可以为生产工作的开展提供很多便利条件。充分考虑原料供应条件。原料供应的保证程度是选址的重要依据,例如油脂加工厂,应建在大豆主产区,如果采用进口大豆为原料,则应建在航运条件较好的港口城市。